Les marqueurs de poids moléculaire pour l'ADN bicaténaire (dsDNA) sont essentiels pour déterminer la taille des molécules d'ADN lors de l'électrophorèse sur gel. Ces marqueurs, également appelés marqueurs d'ADN, sont composés d'un ensemble de fragments d'ADN de tailles connues qui servent de standards pour comparer des échantillons d'ADN inconnus.
Caractéristiques principales et types
Les caractéristiques principales et types des marqueurs de poids moléculaire pour dsDNA incluent :
- Gamme de tailles : Les marqueurs dsDNA sont disponibles dans diverses gammes de tailles, allant de 10 pb jusqu'à 48,5 kb, voire plus de 1000 kb pour des applications spécialisées comme l'électrophorèse en champ pulsé (PFGE). Les gammes courantes incluent 50 à 1500 pb, 25 à 700 pb, 100 à 1000 pb et 500 pb à 10 kb.
- Format : De nombreux marqueurs dsDNA sont fournis dans un format prêt à l'emploi, c'est-à-dire prémélangés avec un colorant de charge, permettant une application directe sur les gels d'électrophorèse. D'autres sont fournis sans colorant prémélangé, mais incluent souvent un flacon séparé de colorant pour plus de commodité.
- Bandes de référence : Certains marqueurs présentent des fragments spécifiques avec une double quantité de matériel ou une intensité accrue (par exemple, 400 pb, 500 pb) pour servir de points de référence facilement identifiables sur le gel, simplifiant la détermination de la taille.
- Composition : Ces marqueurs sont généralement composés de fragments d'ADN linéaires purifiés par chromatographie.
- Applications : Ils sont principalement utilisés pour dimensionner des fragments d'ADN bicaténaire générés par diverses techniques de biologie moléculaire, telles que les digestions par enzymes de restriction, l'amplification par PCR et l'analyse générale de l'ADN sur des gels d'agarose et de polyacrylamide.
- Spécificité : Il est crucial d'utiliser le marqueur de poids moléculaire approprié (ADN vs ARN), car l'ARN migre plus rapidement à travers les gels d'électrophorèse que l'ADN.